《孤岛惊魂》的故事发生在南太平洋一座美丽的世外孤岛“Cabatu”上。玩家所扮演的主角“Jack”是一名拥有神秘背景及不为人知过去的战士，为了逃避过往而选择在南太平洋群岛经营出租快艇的生意。